Hola nacho,
yo hice ese recorrido en Oct-2010, pero en auto. Lo que te puedo decir es que en Valle Fertil tenes combustible, de ahi tenes unos 65 km hasta la entrada del Parque Ischigualasto (V. de la Luna) eso es todo asfalto, luego como te comentaron anteriormente el recorrido es en los propios vehículos, si mal no recuerdo son 34 km que se hacen muy tranqui y parando en cada lugar de interes en donde todos se bajan y el guia da su explicacion, el guía se sube en el 1° vehículo que tiene un lugar, por ahi llegas ahi en la moto y te haces el dobolu
preguntado si te podes subir en algun auto, especulando un poco mas, si vas en marzo es muy raro que vayan flias. porque ya es epoca escolar, por lo tanto hay siempre vehiculos con solo 2 personas a bordo...
.o sea gente grande, Lo ideal es estar a las 8 de la matina ahi y enganchar el 1° grupo, eso te da la ventaja (y todo esto es relativo a tus intereses y ganas) de poder llegar hasta Talampaya (otros 60 km) en donde si o si tenes que contratar la excursion en combi o tambien hay un camion por unos $$ mas, total lo vas a hacer una vez, en donde toda la parte interesante podes ir en el techo, tiene varias filas de asiento y una escalera interior para acceder, es mucho mas lindo que ir dentro de una combi y la vista es panoramica, ademas se hace "un alto en el camino" y te ofrecen una picadita con una copita de vino y todo, jeje.
De esa manera te da para hacer los 2 parque en 1 dia, nosotros seguimos despues hasta Villa Union (70 km mas) donde conseguis alojamiento y combustible sin problemas, es mas, en el restaurant de la YPF del centro se come muy bien y barato.
De ahi, si te animas a unos 30 km de ripio suave podes cruzar la Cuesta de Miranda (busca videos en youtube) y llegar a Nonogasta, de ahi al norte tenes Chilecito y al sur Patquía, sino desandando el camino llegas a Los Baldesitos y de ahi a Patquía, con el tanque lleno, quizas esta opcion no te haga ir y venir cada vez desde V. Fertil a c/u de los parques.
Ventajas de marzo es que anda menos gente, menos probabilidades de faltante de combustible debido a la poca demanda y temperaturas mas agradables.
Espero no haber aburrido y aportado algo.
Saludos y suerte.