Hola y bienvenido.
Yo empezaria probando si tenes aire en el circuito de refrigeracion, con una simple purgada.
Es mas si la comprastes hace poco no sabes a ciencia cierta el tiempo que tiene el liquido y siempre es recomendable cambiarlo. y ahi ya matas 2 pajaros de un tiro, purga y liquido...
Si el problema persiste...recien ahi seguiria con la junta de tapa de cilindros.
postea tambien los valores de temperatura que tiene la moto, calienta ?, trabaja en el rango normal, o normal alto...se fue de temp alguna vez?